工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑(😺)衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后(🕸)喂了(🌂)神奇的药水(🥠)，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的(📹)阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为(🌉)了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛(🤶)利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的(🛀)新一情急之下编造了自己名叫江(🧙)户川柯南，随后柯南寄居(🖼)在了小兰(👵)家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追(🐈)查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪(🚎)犯宣战！