工藤新(⏸)一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士(🎶)，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛(👚)利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江(💹)户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(🖐)的父亲毛利小五郎是一名私家(🔤)侦探，新一可以籍(🙉)着和他一起四出办案一(🆘)起追查黑夜人的下落。柯南在小(⛅)学认识步美等(♉)小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！